我刚刚克隆了一个工作的 miniconda 环境carnd-term1-gpu，它有 tensorflow 和 gpu，使用 tensorflow 版本“0.12.1”。该环境安装了许多其他 python 包。我想升级到最新版本的 tensorflow 所以我根据 tensorflow Ubuntu 做了以下操作:
1) 将现有的工作环境克隆为tflow
conda create --name tflow --clone carnd-term1-gpu
这已成功完成。
2) source激活tflow并使用pip安装
source activate tflow
(tflow) xx@pc:~$ pip install --ignore-installed --upgrade https://storage.googleapis.com/tensorflow/linux/gpu/tensorflow_gpu-1.1.0-cp35-cp35m-linux_x86_64.whl
现在我尝试运行旧环境，假设它不应该被改变。
source activate carnd-term1-gpu
ipython
然后在 ipython 提示符下键入 import numpy as np 并获得以下内容:
---------------------------------------------------------------------------
ImportError Traceback (most recent call last)
<ipython-input-1-4ee716103900> in <module>()
----> 1 import numpy as np
/home/ai/miniconda3/envs/carnd-term1-gpu/lib/python3.5/site-packages/numpy/__init__.py in <module>()
140 return loader(*packages, **options)
141
--> 142 from . import add_newdocs
143 __all__ = ['add_newdocs',
144 'ModuleDeprecationWarning',
/home/ai/miniconda3/envs/carnd-term1-gpu/lib/python3.5/site-packages/numpy/add_newdocs.py in <module>()
11 from __future__ import division, absolute_import, print_function
12
---> 13 from numpy.lib import add_newdoc
14
15 ###############################################################################
/home/ai/miniconda3/envs/carnd-term1-gpu/lib/python3.5/site-packages/numpy/lib/__init__.py in <module>()
6 from numpy.version import version as __version__
7
----> 8 from .type_check import *
9 from .index_tricks import *
10 from .function_base import *
/home/ai/miniconda3/envs/carnd-term1-gpu/lib/python3.5/site-packages/numpy/lib/type_check.py in <module>()
9 'common_type']
10
---> 11 import numpy.core.numeric as _nx
12 from numpy.core.numeric import asarray, asanyarray, array, isnan, \
13 obj2sctype, zeros
/home/ai/miniconda3/envs/carnd-term1-gpu/lib/python3.5/site-packages/numpy/core/__init__.py in <module>()
51 from . import shape_base
52 from .shape_base import *
---> 53 from . import einsumfunc
54 from .einsumfunc import *
55 del nt
ImportError: cannot import name 'einsumfunc'
我以为我通过克隆一个单独的环境并仅更改该环境而受到保护，但似乎一个环境中的安装改变了另一个环境中的行为。正是我以为我在避免的东西!出了什么问题，我该如何解决？到目前为止，新环境似乎运行良好。
我检查了两种环境中的文件日期。 carnd-term1-gpu 环境中的文件日期与我在 tflow 环境中进行升级的同一天。关于如何实现的任何想法？
我尝试将丢失的文件 einsumfunc.py 添加到我的 carnd-term1-gpu 环境中，然后再次启动 Ipython。这次当我执行 import numpy as np 时，无法导入不同的文件。所以看起来我的 carnd-term1-gpu 环境已损坏。
比较每个环境的 conda list 并只查看 numpy，我看到以下内容: 对于 tflow 环境:
numpy 1.11.3 <pip>
numpy 1.12.1 <pip>
numpy 1.11.3 py35_blas_openblas_200 [blas_openblas] conda-forge
对于 carnd-term1-gpu 环境:
numpy 1.11.3 <pip>
numpy 1.11.3 py35_blas_openblas_200 [blas_openblas] conda-forge
然后我使用 conda list --revisions 查看修订。两种环境都只显示 rev 0 的单个修订版。同样，查看 conda-meta/history 仅显示 carnd-term1-gpu 的原始创建日期为 1 月 13 日，tflow 的原始创建日期为 5 月 9 日.所以这个版本pip的组合:
pip 9.0.1 py35_0 conda-forge
结合这个轮子:
https://storage.googleapis.com/tensorflow/linux/gpu/tensorflow_gpu-1.1.0-cp35-cp35m-linux_x86_64.whl
以某种方式破坏了环境 carnd-term1-gpu。这似乎是一个错误，或者我以某种方式从 tensorflow 站 pip 得到了一个损坏的轮子？如果是后者，它怎么会破坏与安装环境不同的环境呢？ 注意 pip 的版本在两种环境中都是相同的。
我执行了以下操作以调查在我进行安装时更改了哪些文件。
find /home/ai/miniconda3/envs/carnd-term1-gpu/ -type f -newermt 2017-05-09 -ls | wc -l
这表明创建/修改了 669 个文件。其中大部分位于 /site-packages/numpy/，但 six.py、pyparsing.py、/setuptools/、/pkg_resources/、easy_install.py、/werkzeug/ 也受到了影响。
conda --version 是 4.2.12
我尝试了以下方法让我的旧环境再次运行。
conda env export > environment.yml
conda env create -f environment.yml -n sdc-gpu
这导致了以下错误:
Could not import setuptools which is required to install from a source distribution.
Traceback (most recent call last):
File "/home/ai/miniconda3/envs/sdc-gpu/lib/python3.5/site-packages/pip/req/req_install.py", line 387, in setup_py
import setuptools # noqa
File "/home/ai/miniconda3/envs/sdc-gpu/lib/python3.5/site-packages/setuptools/__init__.py", line 12, in <module>
import setuptools.version
File "/home/ai/miniconda3/envs/sdc-gpu/lib/python3.5/site-packages/setuptools/version.py", line 1, in <module>
import pkg_resources
File "/home/ai/miniconda3/envs/sdc-gpu/lib/python3.5/site-packages/pkg_resources/__init__.py", line 70, in <module>
import packaging.version
ImportError: No module named 'packaging'
CondaValueError: Value error: pip returned an error.
请您参考如下方法:
我刚从 continuum 得到以下信息; “为了防止这种情况发生，您必须在克隆操作中使用 --copy 标志。conda 设计的核心是广泛使用硬链接(hard link)。这个确切的问题是最大的陷阱之一”
因此，如果我在第一次克隆环境时执行以下操作，我就可以避免破坏旧环境:
conda create --name tflow --copy --clone carnd-term1-gpu
选项 --copy Install all packages using copies instead of hard-or soft-link-ing 将阻止 pip 覆盖文件。
有关此问题以及 future 如何解决的一些正在进行的讨论在此处:conda pip breaks
我唯一的恢复选项是重新安装每个损坏的包。将 pip 与 conda 一起使用时要小心......
