python之csv.reader 只读一行

我是 python 的新手。我正在尝试处理一个非常大的 .csv 文件(约 680 万行)上的数据。这些行的示例如下所示:

Group1.1    57645   0.0954454545  
Group1.1    57662   0.09556544778 
Group1.13   500 0.357114538  
Group1.13   504 0.320618298  
Group1.13   2370    0.483851368  
Group1.14   42  0.5495688 

第一列给出了组，第二列给出了位置，第三列给出了我正在读取以运行计算的值。我正在尝试根据位置在“滑动窗口”中执行这些计算。另一个因素是每个组都是分开计算的，因为每个组的位置编号都重新开始。在我的代码中，我首先尝试在执行任何操作之前将组 ID 作为列表读取，“统一”该列表，然后使用该列表作为仅对该特定组执行“滑动窗口”的基础。然后我移动到唯一列表中的下一个组 ID 并再次运行计算。这是我的代码的基础知识(unique1 函数是一种简单的方法来统一列表:

for row in reader: 
    scaffolds.append(row[0]) 
    unique1(scaffolds) 
    newfile.seek(0) 
    reader=csv.reader((line.replace('\0','') for line in newfile), delimiter="\t") 
    if row[0] == unique_scaffolds[i]: 
        #...perform the calculations 
    else: 
        i+=1 

我遇到的问题是它只读取我数据集的第一行，仅此而已。因此，如果我在“for row in reader”之后插入一个“print row”，我会得到这样的输出:

['Group1.1', '424', '0.082048032'] 

如果我编写完全相同的代码而没有任何进一步的计算和循环，它将打印数据集中的每一行。在这种情况下，我将如何读取此循环开头的每一行？

请您参考如下方法:

您每次都在重新初始化阅读器。本质上，这导致它卡在第一行。试试这个

reader=csv.reader((line.replace('\0','') for line in newfile), delimiter="\t") 
for row in reader: 
    scaffolds.append(row[0]) 
    unique1(scaffolds) 
    newfile.seek(0) 
 
    if row[0] == unique_scaffolds[i]: 
        #...perform the calculations 
    else: 
        i+=1