当我使用 pandas 处理我的数据时，出现标题这样的错误。我的数据列不相等，所以我按降序排列。第一行最长，下一行较短，依此类推。当文件较小时，pandas 可以成功处理。但是在我将所有数据写入文件后，它无法处理并显示此错误。
这是我的代码:
def sequencein(filepath):
print (filepath)
print("time", time.time())
data = pd.read_table(filepath, header=None)
print("time", time.time())
matr = data.values
print("sequence shape:", matr.shape)
return matr
文件的行尾如下所示: enter image description here
请您参考如下方法:
documentation说有两个引擎:
engine : {‘c’, ‘python’}, optional
Parser engine to use. The C engine is faster while the python engine is currently more feature-complete.
问题似乎只出现在“c”引擎上，它是为较大的文件自动选择的。
所以，你可以试试
data = pd.read_table(filepath, header=None, engine='python')
