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python之正则表达式解析 Namelist 输入文件中的键值对

2024年08月29日31lori

我有一个 Fortran“名单”格式的输入文件,我想用 python 正则表达式对其进行解析。最简单的演示方法是用一个虚构的例子:

$VEHICLES 
 CARS= 1, 
 TRUCKS = 0, 
 PLAINS= 0, TRAINS = 0, 
 LIB='AUTO.DAT', 
C This is a comment 
C Data variable spans multiple lines 
 DATA=1.2,2.34,3.12, 
      4.56E-2,6.78, 
$END 
$PLOTTING 
 PLOT=T, 
 PLOT(2)=12, 
$END 

因此键可以包含常规变量名称字符以及括号和数字。值可以是字符串、 bool 值(T、F、.T.、.F.、TRUE、FALSE、.TRUE.、.FALSE。都是可能的)、整数、 float 或以逗号分隔的数字列表.键通过等号连接到它们的值。 Key-Value 对以逗号分隔,但可以共用一行。对于一长串数字,值可以跨越多行。注释是任何以 C 开头的行。'=' 和 ',' 前后的间距通常不一致。

我想出了一个有效的正则表达式来解析键和值并将它们放入有序字典(需要保留输入的顺序)。

到目前为止,这是我的代码。为了完整起见,我已经包括了从读取文件到保存到字典的所有内容。

import re 
from collections import OrderedDict 
 
f=open('file.dat','r') 
file_str=f.read() 
 
#Compile regex pattern for requested namelist 
name='Vehicles' 
 
p_namelist = re.compile(r"\$"+name.upper()+"(.*?)\$END",flags=re.DOTALL|re.MULTILINE) 
 
#Execute regex on file string and get a list of captured tokens 
m_namelist = p_namelist.findall(file_str) 
 
#Check for a valid result 
if m_namelist: 
    #The text of the desired namelist is the first captured token 
    namelist=m_namelist[0] 
 
#Split into lines 
lines=namelist.splitlines() 
 
#List comprehension which returns the list of lines that do not start with "C" 
#Effectively remove comment lines 
lines = [item for item in lines if not item.startswith("C")] 
 
#Re-combine now that comment lines are removed 
namelist='\n'.join(lines) 
 
#Create key-value parsing regex 
p_item = re.compile(r"([^\s,\=]+?)\s*=\s*([^=]+)(?=[\s,][^\s,\=]+\s*\=|$)",flags=re.DOTALL|re.MULTILINE) 
 
#Execute regex 
items = p_item.findall(namelist) 
 
#Initialize namelist ordered dictionary 
n = OrderedDict() 
 
#Remove undesired characters from value     
for item in items: 
    n[item[0]] = item[1].strip(',\r\n ') 

我的问题是我的处理是否正确。我意识到有一个 ConfigParser 库,我还没有尝试过。我这里的重点是正则表达式:

([^\s,\=]+?)\s*=\s*([^=]+)(?=[\s,][^\s,\=]+\s*\=|$) 

但我继续并包含了其他代码以确保完整性并演示我正在用它做什么。对于我的正则表达式,因为值可以包含逗号,键值对也用逗号分隔,所以没有简单的方法来隔离键值对。我选择使用前瞻性查找下一个键和“=”。这允许“=”和下一个键之间的所有内容成为值。最后,因为这对最后一对不起作用,所以我将“|$”放入前瞻性中,这意味着如果没有找到另一个“VALUE=”,则查找字符串的末尾。我认为将值与 [^=]+ 匹配,然后进行前瞻比尝试匹配所有可能的值类型要好。

在写这个问题时,我想出了一个替代的正则表达式,它利用了数字是列表中唯一可以存在的值这一事实:

 ([^\s,\=]+?)\s*=\s*((?:\s*\d[\d\.\E\+\-]*\s*,){2,}|[^=,]+) 

这个匹配 2 个或更多数字的列表 (?:\s*\d[\d\.\E\+\-]*\s*,){2,} 或下一个逗号前的任何内容,[^=,]。

这些有些困惑的正则表达式是解析此类文件的最佳方式吗?

请您参考如下方法:

我建议开发更复杂的解析器。

我偶然发现了实现非常相似的解析器功能的谷歌代码托管项目:Fortran Namelist parser for Python prog/scripts但它是为不同的格式构建的。 我稍微玩了一下并更新了它以支持您示例中的格式结构:

请在要点上查看我的版本: Updated Fortran Namelist parser for python https://gist.github.com/4506282

我希望这个解析器对您的项目有所帮助。

这是在解析 FORTRAN 代码示例后由脚本生成的示例输出:

{'PLOTTING':  
    {'par':  
        [OrderedDict([('PLOT', ['T']), ('PLOT(2) =', ['12'])])], 
    'raw': ['PLOT=T', 'PLOT(2)=12']}, 
 'VEHICLES':  
    {'par':  
        [OrderedDict([('TRUCKS', ['0']), ('PLAINS', ['0']), ('TRAINS', ['0']), ('LIB', ['AUTO.DAT']), ('DATA', ['1.2', '2.34', '3.12', '4.56E-2', '6.78'])])], 
  'raw':  
                ['TRUCKS = 0', 
                  'PLAINS= 0, TRAINS = 0', 
                  "LIB='AUTO.DAT'", 
                  'DATA=1.2,2.34,3.12', 
                  '4.56E-2,6.78']}}