我正在尝试在 tensorflow 中实现 STDP(尖峰时间相关可塑性)。这有点复杂。有什么想法(完全在 tensorflow 图中运行)吗?
它是这样工作的:假设我有 2 个输入神经元,它们通过这个矩阵连接到 3 个输出神经元:[[1.0, 1.0, 0.0], [0.0, 0.0, 1.0]](输入神经元 0 连接到输出神经元 0 和 1...)。
假设我有输入神经元的这些尖峰(2 个神经元,7 个时间步长):
Input Spikes:
[[0, 0, 1, 1, 0, 1, 0],
[1, 1, 0, 0, 0, 0, 1]]
输出神经元的这些尖峰(3 个神经元,7 个时间步长):
Output Spikes:
[[0, 0, 0, 1, 0, 0, 1],
[1, 0, 0, 0, 0, 0, 0],
[0, 0, 0, 0, 1, 1, 1]]
现在,对于每个非零权重,我想计算一个 dw。例如,对于连接到输出神经元 0 的输入神经元 0:
输入神经元 0 的尖峰时间戳是 [2, 3, 5],输出神经元 0 的时间戳是 [3, 6]。现在,我计算所有增量时间:
Delta Times = [ 2-3, 2-6, 3-3, 3-6, 5-3, 5-6 ] = [ -1, -4, 0, -3, 2, -1 ]
然后,我计算一些函数(实际的 STDP 函数,这对这个问题并不重要 - 一些指数函数)
dw = SUM [ F(-1), F(-4), F(0), F(-3), F(2), F(-1) ]
这就是连接输入神经元 0 和输出神经元 0 的权重的 dw。对所有非零权重重复此操作。
所以我可以在 numpy 中完成所有这些,但我希望能够完全在一个 tensorflow 图中完成。特别是,我坚持计算增量时间。以及如何对所有非零权重并行执行所有这些操作。
这是实际的 stdp 函数,顺便说一句(常量可以是参数):
def stdp_f(x):
return tf.where(
x == 0, np.zeros(x.shape), tf.where(
x > 0, 1.0 * tf.exp(-1.0 * x / 10.0), -1.0 * 1.0 * tf.exp(x / 10.0)))
关于性能的说明:下面@jdehesa 给出的方法既正确又聪明。但事实证明它也很慢。特别是,对于一个由 784 个输入神经元馈送到 400 个神经元的真实神经网络,超过 500 个时间步长,spike_match = 步骤执行 (784, 1, 500, 1) 和 (1, 400) 的乘法, 1, 500) 张量。
请您参考如下方法:
我对 STDP 不熟悉,所以我希望我能正确理解你的意思。我认为这符合您的描述:
import tensorflow as tf
def f(x):
# STDP function
return x * 1
def stdp(input_spikes, output_spikes):
input_shape = tf.shape(input_spikes)
t = input_shape[-1]
# Compute STDP function for all possible time difference values
stdp_values = f(tf.cast(tf.range(-t + 1, t), dtype=input_spikes.dtype))
# Arrange in matrix such that position [i, j] contains f(i - j)
matrix_idx = tf.expand_dims(tf.range(t - 1, 2 * t - 1), 1) + tf.range(0, -t, -1)
stdp_matrix = tf.gather(stdp_values, matrix_idx)
# Find spike matches
spike_match = (input_spikes[:, tf.newaxis, :, tf.newaxis] *
output_spikes[tf.newaxis, :, tf.newaxis, :])
# Sum values where there are spike matches
return tf.reduce_sum(spike_match * stdp_matrix, axis=(2, 3))
# Test
input_spikes = [[0, 0, 1, 1, 0, 1, 0],
[1, 1, 0, 0, 0, 0, 1]]
output_spikes = [[0, 0, 0, 1, 0, 0, 1],
[1, 0, 0, 0, 0, 0, 0],
[0, 0, 0, 0, 1, 1, 1]]
with tf.Graph().as_default(), tf.Session() as sess:
ins = tf.placeholder(tf.float32, [None, None])
outs = tf.placeholder(tf.float32, [None, None])
res = stdp(ins, outs)
res_val = sess.run(res, feed_dict={ins: input_spikes, outs: output_spikes})
print(res_val)
# [[ -7. 10. -15.]
# [-13. 7. -24.]]
这里我假设 f 可能很昂贵(并且它的值对于每对神经元都是相同的),所以我只对每个可能的时间增量计算一次,然后重新分配计算值在一个矩阵中,所以我可以在输入和输出尖峰发生的坐标对上相乘。
我使用 f 的恒等函数作为占位符,因此在这种情况下,结果值实际上只是时间差的总和。
编辑:仅供引用,将 f 替换为您包含的 STDP 函数:
def f(x):
return tf.where(x == 0,
tf.zeros_like(x),
tf.where(x > 0,
1.0 * tf.exp(-1.0 * x / 10.0),
-1.0 * 1.0 * tf.exp(x / 10.0)))
结果是:
[[-3.4020822 2.1660795 -5.694256 ]
[-2.974073 0.45364904 -3.1197631 ]]
